Pewnie jakimś miks JS po stronie przeglądarki + czegoś backendowego jak PHP, Python, czy w zasadzie cokolwiek innego.
Patrząc na szybko po necie Margonem i OGame miały backend w PHP, choć ten wybór pewnie miał więcej związku z tym co było na topie w momencie ich powstania, niż z czymkolwiek innym.
Bardziej ogólnie pisząc, jeżeli chcesz robić gry przeglądarkowe, to zdecydowanie zacznij od JavaScriptu, w szczególności, że można obecnie też w tym backend pisać (Node/Express/etc). To zresztą jest niezły język na początek - szybko widać efekty tego co się pisze w kodzie, bardzo aktywna społeczność, masa gotowych rozwiązań w necie, i w zasadzie nie potrzebujesz na początek nic poza przeglądarką ;)