wszystkie pliki powinny znaleźć się w repo, ale nie te, które zawierają dane, które zawierają dane specyficzne dla danego środowiska :P jeśli w pliku jest klucz do aws s3, login i hasło do bazy danych lub coś co zrobi z użytkowników dobro narodowe to, ten plik nie powinien być brany pod uwagę w "projekcie githuba" czyli go nie commituj :P
Wszelkie dane które, powinien znać tylko, administrator pozostawiasz administratorowi, czyli tego nie udostępniasz
To co udostępniasz w repo, jest dla Ciebie i innych jest publiczne :P