Nie za bardzo rozumiem, ale wydaje mi się że chodzi Ci o wyszukanie danego znaku i wpisaniu w jego miejsce X?
No to tworzysz tablicę znaków i posługując się dwiema pętlami for wpisujesz tam co Ci odpowiada, później w kolejnych dwóch pętlach for wyszukujesz tego znaku który chcesz i wpisujesz X.
for(int i = 0; i<n; i++)
{
for(int j =0; j<m; j++)
{
if(szukana == tablica[i][j])
{
tablica[i][j] = 'X'
}
}
}