Osobiście bym spojrzał bardziej na kompatybilność ze "specjalistycznymi aplikacjami" które masz na myśli - smutną rzeczywistością jest że przez dominację CUDA, karty AMD są często gorzej wspierane (albo nie działają w ogóle, albo z niedostępnymi funkcjonalnościami, albo po prostu - wolniej).
Jeszcze inne pytanie brzmi, co masz na myśli przez "modelowanie 3D i grafikę". Bo wydajność kart staje się znacznie ważniejsza gdy już renderujesz grafikę, ale niekoniecznie gdy modelujesz.