Tak, jeśli podłączysz jeden monitor pod HDMI na karcie graficznej, a drugi na DP na karcie graficznej, to oba monitory będą działać.
Co więcej, pod to złącze DP pewnie możesz podpiąć do 4ch monitorów (chyba, że karta jest archaiczna) za pomocą albo huba DP albo MST (czyli tzw. daisy chainingu monitorów).
Natomiast jak masz włożoną kartę graficzną, to HDMI na płycie głównej jest na 90% nieaktywne.