Zrób update za pomocą
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get dist-upgrade
Po drugie ten błąd nie jest poważny, popatrz w logi systemowe co pada, na 100% jest to związane z unity. Ja mam teraz 16.04 LTS i działa bardzo dobrze. Co do utraty kompilatora... zainstaluj go na nowo, pakiety open-jdk itp.
Polecam używanie synaptic zamiast software center. sudo apt-get install synaptic
Uzywam od lat do instalacji oprogramowania.