Nie musisz. "python2" włączy Pythona 2, "python3" Pythona 3. "pip2" uruchomi Pipa dla Pythona 2, "pip3" uruchomi Pipa dla Pythona 3.
Natomiast żeby mieć to porządnie odizolowane, powinno się użyć virtualenv/virtualenvwrappera (co w zasadzie powinno się robić z każdym większym projektem).