Ponieważ trzecia opcja menu musi pomieścić 5 bloków z tekstem a więc <ul class="main"> rozciąga się tak by wszystkie pomieścić automatycznie dopasowując wysokość pozostałych opcji. Jeżeli chcesz mieć wszystkie opcje na jednym poziomie możesz ustalić stałą wysokość elementów li listy main lub zastosować vertical align
nav .main li {
display: inline-block;
vertical-align: top;
}