Z logiki Twojego zapytania wynika że masz "zepsuty Windows" a to znaczy że nie możesz go uruchomić.
Masz "czynny" Ubuntu i chcesz go usunąć a jedyną możliwością komunikacji z komputerem jest Ubuntu.
Uruchom instalatora Windowsa,wskaż dysk na którym ma być zainstalowany.Potem pójdzie "z górki".
Zanim cokolwiek sformatujesz,przygotuj sobie na penie lub innym nośniku instalator Windowsa lub Ubuntu.
Inną sprawą jest to że pytanie zadałeś tak enigmatycznie że muszę się domyślać czy chodzi o dwa dyski czy 2 partycje a może jeszcze inaczej?
sprawa wygląda tak mam 2 dyski twarde 1.120gb chyba 2.80gb
.....a na drugim Ubuntu najnowsza wersja (dysk 80gb?)
Zacznij od podstaw.
Jeśli masz 2 dyski,podaj znamionową pojemność każdego z nich.
Przygotuj instalatora z Windowsem,sprawdź czy instalator uruchamia się na kompie (boot w biosie)
Uruchom instalatora i formatuj (kasuj) co się da,i co chcesz :)