Po pierwsze Visual Studio Code, a Visual Studio to nie jest to samo.
Po drugie, domyślnie JavaScript działa w przeglądarce i to w jej konsoli wyświetlają się console logi, a nie wewnątrz VS Code.
To, do czego się odnosisz, to środowisko uruchomieniowe, które pozwoli Ci używać JavaScript poza przeglądarką, czyli Node.js (są inne, ale ten ciągle jest najpopularniejszy).