Udało mi się rozwiązać ten problem poprzez edytowanie pliku /etc/ssh/sshd_config.
Zmienilem Subsystem sftp /user/lib/openssh/sftp-server na Subsystem sftp internal-sftp
Dodalem ChrootDirectory /home/%u
Oraz przeniosłem prawa własności katalogu użytkownika na root, co pomogło mi uwiezic uzytkownika tylko i wyłacznie w jego katalogu.