To, jak piszesz kod, nijak się ma do tego, gdzie zapisujesz dane. Jak najbardziej dalej używa się baz danych.
Zmienia się jedynie sposób obróbki tych danych po wyciągnięciu z bazy. Nie wiem, jak wcześniej pisałeś PHP, ale w kodzie obiektowym będziesz mieć te dane przedstawiane w formie klas i obiektów, które będą miały odpowiednie metody do pracy z nimi.