Vlany z natury nie "widzą się", po to je wprowadzono. Ruch pomiędzy vlanami jest możliwy jedynie poprzez routing pomiędzy odpowiednimi podsieciami. Najprościej co możesz zrobić to skonfigurować dwa vlany, w jednym z nich umieścić serwer i porzez ACL zeznowić na ruch pomiędzy vlanami tylko z i do serwera. Druga opcja to 3 vlany, dwa, o których mówisz i wtedy ACL wycinasz cały ruch pomiędzy nimi. 3 vlan dla serwera i tam zezwalasz na ruch do obu poprzednich vlanów.
Co do Twojego pytania o adresację jest to technicznie do zrobienia, ale jest to bardzo zły pomysł, ponieważ ogromnie komplikuje budowę sieci, a wiesz mi, chcesz, aby Twoja sieć była możliwie jak najprostsza.