Możesz użyć np. moduł keyboard i zmienną która będzie przechowywać stan czy jest zatrzymany stoper czy nie tzw. flaga.
przykład (naciśnięcie litery b na klawiaturze zatrzymuje stoper, ponowne naciśnięcie uruchamia)
import os, time, keyboard
clearScreen = lambda: os.system('cls' if os.name in ('nt', 'dos') else 'clear')
czas = 0
time_loop = 0
pause = False
print(czas)
while True:
if not pause:
time_loop += 0.05
if time_loop > 0.95:
time_loop = 0
czas += 1
clearScreen()
print(czas)
if keyboard.is_pressed('b') and not pause:
pause = True
print('Stop')
time.sleep(0.05)
elif keyboard.is_pressed('b') and pause:
pause = False
time.sleep(0.05)
time.sleep(0.05)