Wycięcie niepotrzebnego elementu na zdjęciu RTG płuc MATLAB

pytanie zadane 15 lipca 2020 w Inne języki przez XavRock Obywatel (1,390 p.)

Witam.

Czy wie ktoś jak wyciąć niepotrzebne elementy na zdjęciu MRI płuc ?

Interesują mnie tylko te elementy które są na płucach, to te zielone dwie części. Na nich są różowe anomalie, i tylko o nie mi chodzi.

mri2grey = rgb2gray(mri);
I_Filter = imbinarize(mri2grey,'adaptive', 'Sensitivity',0.59);
I_Filter = medfilt2(I_Filter, [5 5]);
SE_Filter = strel('disk',6);
I_Filter = imclose(I_Filter,SE_Filter);
imshowpair(mri2grey,I_Filter);

Kod do pierwszego obrazka.

Dzięki za każdą pomoc.

komentarz 15 lipca 2020 przez KumberTwo Dyskutant (8,270 p.)

Hej, niestety nie znam odpowiedzi na twoje pytanie, ale jestem ciekawy co to jest za program, oraz zdjęcia, które wkleiłeś. Do czego służy ten kod do obrazka?

komentarz 16 lipca 2020 przez XavRock Obywatel (1,390 p.)

Piszę program w matlabie, który pokazuje zniszczenia płuc min. po COVID19.

Ten kod filtruje zdjęcie RTG, pierw przerabia go na szare zdjęcie. Kolejnym krokiem jest binaryzacja obrazu, medfilt2 to filtrowanie mediany na obrazie. Strel predefiniuje element konstrukcyjny. imclose() zamyka luki między białymi pikselami.

komentarz 16 lipca 2020 przez XavRock Obywatel (1,390 p.)

Zdjęcia to RTG płuc po COVID.

komentarz 16 lipca 2020 przez KumberTwo Dyskutant (8,270 p.)

Wow, brzmi nieźle...

1 odpowiedź

odpowiedź 16 lipca 2020 przez techno16 Gaduła (4,780 p.)
wybrane 16 lipca 2020 przez XavRock

Najlepsza

Takie dosyć niecodzienne pytanie

Zdjęcia medyczne zazwyczaj koduje się w Pythonie, bo ma największy potencjał i się do tego najlepiej nadaje.

Nie mam pojęcia jak Ci pomóc, ale może spróbuj przeszukać Githuba. Sam znalazłem coś takiego https://github.com/JoHof/lungmask

komentarz 16 lipca 2020 przez XavRock Obywatel (1,390 p.)

Dzięki

komentarz 16 lipca 2020 przez tkz Nałogowiec (42,000 p.)

@techno16, Zdjęcia medyczne zazwyczaj koduje się w Pythonie, bo ma największy potencjał i się do tego najlepiej nadaje.

Dlaczego?

komentarz 17 lipca 2020 przez techno16 Gaduła (4,780 p.)

Ponieważ na Pythonie możesz stworzyć AI, które będzie wcześnie rozpoznawało choroby albo czy pacjentowi coś dolega. Ogólnie Python to tylko skrypty/deep/machine learning. I w tym jest najlepszy

komentarz 17 lipca 2020 przez techno16 Gaduła (4,780 p.)

First, Python is relatively easy to use. It has easy to understand syntax and doesn’t need to be compiled. For the most part, error messages are helpful when debugging. Second, it is free and has a ton of great libraries (it has a lot of libraries because many people use it and many people use it because it has a lot of libraries). Third, it has a some nice statistics packages, which make it very useful for doing medical research.

komentarz 18 lipca 2020 przez tkz Nałogowiec (42,000 p.)

@techno16, W innych językach również możesz stworzyć to co wymieniłeś. Czy jest najlepszy? Odważne stwierdzenie. Szczególnie, że nie znasz wymagań. Przypadkowy opis po angielsku nic nie wnosi.

techno16 is completely wrong, because that's what the entry says in English, and as we know, what's different than Polish must be true.

Taki sam poziom merytoryczny. Oczywiście, to ironia, żebyś nie czuł się urażony...

komentarz 19 lipca 2020 przez techno16 Gaduła (4,780 p.)

Może się źle wyraziłem... Python w medycynie ma służyć lekarzom a nie programistom. Dlatego jest najlepszy. Jego składnia jest prosta i zrozumiała.

komentarz 19 lipca 2020 przez tkz Nałogowiec (42,000 p.)

Lekarzom ma służyć wynik, nie sposób w jaki został uzyskany. Etap wychwalania jednego rozwiązania jest mizerny w końcowym rozrachunku. Przywiązanie do technologi jest błędem. Również do opracowywania wyników służy R, o którym nie wspomniałeś, a króluję w na zachodniej części globu, mówię z doświadczenia, "prawda" statystyczna może być kompletnie inna. Kwestia celu, nie drogi.