Musisz dobrać odpowiednie właściwości css. Unikaj animowania margin, staraj sie modyfikować transform, opacity. Pokaz CSS to coś podpowiem. Widocznie komorka ma zbyt słaby procesor dla twojej animacji.
Przy scrolowaniu moze mieć znaczenie to czy masz jakieś handlery w java script. Jesli wykonujesz samodzielnir animacje w js s warto skorzystać z natywnego rozwiazania lub opartego o requestanimationframe
Jeśli chcesz to mozesz obczajić też moja prezentacje o wydajnosci moze coś znajdziesz dla siebie ;-). https://forum.pasja-informatyki.pl/430985/moja-prezentacja-na-temat-przyspieszania-stron-internetowych