1. Możliwe, że ten plik tekstowy jest "za duży" jak na Notepad++, spróbuj go otworzyć w innym programie.
2. Wejdź w "Settings -> Preferences..." i zobacz ścieżkę jaką masz do backup'u, skopiuj ją i wejdź pod jej adres. Tym samym odzyskując z kopii utracone dane. Skopiuj ten plik w inne miejsce i go otwórz.
3. Spróbuj zmienić kodowanie pliku np. na UTF-8 z BOM i bez BOM.
4. Wyłącz/Usuń wszystkie plugin'y i dodatki (wszystko co zbędne).
5.
https://notepad-plus-plus.org/community/topic/13302/fix-corrupted-txt-file-null/56
6. Jakiś "hex editor", czy debug'owanie tego pliku, "byte" (bajt) po "byte" (bajcie) i tego typu sposoby na sprawdzenie, czy dałoby radę odkodować ten plik, czy może jest na tyle uszkodzony (nadpisany), o ile w ogóle jest, że to byłoby niemożliwe.