To w jakim formacie zapiszesz kolor oczywiście nie będzie miało żadnego wpływu na odbiór samej strony, natomiast będzie mieć wpływ na czytelność arkusza stylów.
Zapis szesnastkowy jest prawie niemożliwy do "wyobrażenia", aby sprawdzić co się kryje za "szyfrem" trzeba się posiłkować dodatkowymi narzędziami, z tego powodu stosowałbym go w ostateczności.
Jestem zdania, że powinno się używać formatów przyjaznych dla naszych ludzkich móżdżków jak HSL (który jest najprostszy do zinterpretowania) czy też RGB (ze względu na to że można prosto określić czy barwa danego koloru jest bardziej zbliżona do zielonego, niebieskiego czy czerwonego). Takie zapisywanie kolorów powoduje, zwiększenie czytelności stylów, co za tym idzie - ułatwia to pracę innym programistom, czy dokonania ewentualnej zmiany/korekty koloru.