Możesz zawsze stworzyć zmienną np. $strona w każdym z plików, wtedy otrzymasz rodzaj każdej z stron.
<?php $strona = 'glowna'; ?>
include('header.php');
// KOD
include('footer.php');
Zakładam że generator menu będzie wyglądał tak:
<?php
for (...) { ?>
<a class="<?php echo ($strona == $rodzaj)? 'active' : ''; ?>"> ... </a>
<? php } ?>