No jak to nie wiesz? Używasz funkcji system, która wykonuje polecenie systemowe. Jako polecenia używasz polecenia skryptowego powłoki CMD o nazwe start "nazwa_twojego_programu.exe".
Przykład:
#include <windows.h> //lub cstdio
//jakis kod
system( "start twoj_program.exe" );
Jako twoj program podaje sciezke względną bądź bezwzględną do pliku exe.