Nikogo to nie interesuje jaki masz papier (masz wyższe kierunkowe - masz).
Na studiach informatycznych licencjackich jest z reguły większe natężenie przedmiotów związanych z matematyką. Na politechnice masz natomiast przedmioty typu elektronika, układy cyfrowe czy programowanie mikrokontrolerów. Jest też różnica w długości studiów - licencjat trwa jeden semestr mniej.
Popatrz w syllabusy kierunków i na tej podstawie wybierz, co bardziej Ci odpowiada. Moim zdaniem studia inżynierskie w przypadku informatyki to lepsza opcja, aczkolwiek pewnie znajdzie się ktoś, kto ma inne zdanie ;]