Najlepiej będzie po protu insertować do bazy danych poszczególn rekordy, w których będą komentarze.
Oczywiście mówimy tutaj o umiarkowanym ruchu na stronie, oraz serwerze, który nas nie ogranicza. Jeśli mielibyśmy postawić np. youtube na serwerze z drewna, to wtedy musielibyśmy kombinować dość mocno, bo zapytania do bazy by go zabiły. Zaletą relacyjnych baz danych jest to, że w bardzo prosty sposób możemy uzyskać wiele danych: Kto wstawił ile komentarzy, wszystkie komentarze osoby, wszystkie komentarze w danym wątku itd.