Możesz takie coś stworzyć, nadając jakiemuś elementowi position:fixed oraz taki "iks". [x], który ten komunikat wyłączy. Ten "iks" mógłby być np. hiperłączem. Oczywiście w JS piszesz skrypt, który np. po 30 sekundach po wejściu na strone wyświetla komunikat i go chowa bądź usuwa po x. sekundach upłynięcia czasu. Nie wiem, czy tego nie można czasem w CSS wykonać.
Nie wiem czasem, czy nie chodziło ci po prostu o:
<script>
window.open('http://google.com', 'windowName', "height=100,width=100");
</script>