Piszesz, że pobierasz za pomocą Ajaksa, a potem pytasz, czy jest możliwość przesłania danych do JS… To wygląda trochę tak jakbyś używał technologii, nie rozumiejąc jej zupełnie.
Na tym właśnie polega Ajax, że pobiera stronę wygenerowaną w PHP. To jest normalne żądanie HTTP z tym, że odbywa się w tle i bez potrzeby przeładowania całej strony.