Nie wiem czy dobrze zrozumiałem pytanie, ale w zależności co chcesz zapisywać widzą dwie opcje:
- Jeśli chcesz zapisywać informacje dotyczące wykonywania się programu polecam sprawdzić działanie Loggera (java.util.logging.Logger - dokumentacja)
Należy stworzyć obiekt klasy. Metody pozwalają na zapisywanie wiadomości z różnym poziomem istotności - wyjątki lub niechciane działanie "logujesz" z najwyższym priorytetem, a oczekiwane działanie programu (np. stworzenie obiektu, wywołanie metody itp.) z niższym.
W sieci łatwo znaleść przykłady użycia.
- Jeśli zależy ci na tym żeby program zapisywał dane do pliku to najprościej wydaje się, wspomniany przez Mar Cin sposób:
Poczytaj sobie np. o klasie PrintWriter :)