Powinno być:
if ((q>49)||(w>49)||(e>49)||(r>49)||(t>49)||(y>49))
{
cout<<"Liczby musza byc mniejsze od lub rowne 49";
Sleep(3000);
return 0;
}
Liczba różna od 0 ma wartość logiczną 1, więc Twój if wykona się, jeśli chociaż jedna zmienna z q,w,e,r,t będzie różna od 0.