Przed wykonaniem tych operacji zrób backup danych.
Musisz usunąć GRUB z sektora startowego (MBR). Odpal live CD Linuxa i wpisz:
dd if=/dev/zero of=/dev/sdX bs=446 count=1
Pod rescue CD Windowsa będzie to, jeśli dobrze pamiętam:
bootrec /fixmbr
To tyle, jeśli chodzi o usunięcie samego GRUBa, Twój problem leży jednak w innym miejscu i nie musisz wymazywać informacji z MBR, bo podczas instalacji systemu i tak zostaną one nadpisane.
Windows lubi stwarzać problemy podczas tworzenia partycji i wyświetlać komunikaty typu "wystąpił błąd o treści błąd" (ja to tak interpretuję, bo zazwyczaj nie ma tam żadnych szczegółów). Rozwiązaniem jest podzielenie dysku na partycje przed instalacją Windowsa, a w instalatorze wybranie jedynie partycji przeznaczonej do instalacji. Konkretniej - Windows potrzebuje partycji na bootloader z flagą boot (tworzy ją automatycznie przy partycjonowaniu, to ta mini-partycja 500 MB) oraz "głównej" partycji dla systemu.
Najprościej będzie ci użyć programu GParted, koniecznie uruchomionego z live USB. Mini distro z tym programem możesz pobrać stąd: http://gparted.org/liveusb.php
Po uruchomieniu GParted z live CD z górnego menu wybierz najpierw swój dysk, a następnie Device -> Create Partition Table. Teraz wybierz gpt (jeśli twoja płyta główna korzysta z UEFI), albo msdos (jeśli nie masz UEFI). Zostanie utworzona nowa tablica partycji.
Teraz utwórz sobie partycje na dysku - jedna partycja ok. 500 MB z systemem plików NTFS, a druga dla Windowsa (minimum 20 GB, NTFS). Zapisz zmiany.
Kolejny krok, to ustawienie flagi boot dla tej 500 MB partycji, na której będzie znajdować się bootloader Windowsa - w GParted kliknij prawym przyciskiem myszy na tę partycję i wybierz Manage Flags. W nowym okienku zaznacz boot, poczekaj chwilkę i zamknij GParted.
Teraz możesz przystąpić do instalacji Windowsa - przy instalacji wybierz tę minimum 20 GB partycję przeznaczoną na system.