Rozumiem, że masz server VPS kupiony, a nie zwykły hosting www. To tak tylko się upewniam.
Jeżeli tak, to z pewnością dostałeś hasło do roota i ip własnego serwera. Jeżeli tak, to z linuksa łączysz się przez konsolę za pomocą polecenia
ssh user_name@ip_of_the_server
w miejsce user_name wpisujesz swoją nazwę np. root, a ip to adres twojego serwera. Jeżeli nie posiadasz Linuxa na swoim komputerze to potrzebujesz zainstalować program putty. To jest taki emulator konsoli bash. Tam spokojnie z linii komend sobie wszystko instalujesz. Mam nadzieję, że pomogłam